En sus inicios era un colegio libre adaptado, que dependía del Ayuntamiento. Tenía dos profesores pagados por el Ministerio y otros pagados por el propio Ayuntamiento.

Cuando se concede la construcción del Instituto todo el profesorado pasa a depender del M.E.C.

Mientras se construía el edificio actual se alquilaron algunas aulas del Colegio Calasancio para atender a los alumnos.

En Mayo de 1982 se inaugura el nuevo edificio y se ordena el traslado al nuevo centro. Al nuevo edificio se le dio el nombre de Instituto Mixto de Almazán. Las clases comienzan a impartirse aquí en Septiembre de 1982.

En abril de 1992 pasó a llamarse Instituto Gaya Nuño